กว่า 200 ปีที่ผ่านมา มิชชัน ซาน ฮวน คาปิสทราโนถือกำเนิดขึ้นมาโดยเป็นชุมชนที่เลี้ยงชีพด้วยตนเองโดยเน้นไปที่เกษตรกรรม อุตสาหกรรม การศึกษาและศาสนา สถานที่สำคัญทางประวัติศาสตร์แห่งนี้เป็นหนึ่งในจำนวนสำนักเผยแพร่ศาสนา 21 แห่งที่สร้างขึ้นมาภายในแคลิฟอร์เนียทั้งหมด บางคนก็บอกว่านี่คือจุดกำเนิดของออเรนจ์เคาน์ตี้
มิชชันนี้ถูกค้นพบในช่วงปลายปี 1700 ในระหว่างการขยายอาณาเขตของพวกสเปนและได้มีการเผยแพร่คริสต์ศาสนามายังคนอเมริกันพื้นเมืองที่อยู่ในพื้นที่ ทุกวันนี้ได้กลายมาเป็นแหล่งท่องเที่ยวยอดนิยมที่บอกเล่าเรื่องราวเกี่ยวกับประวัติศาสตร์การผสมผสานวัฒนธรรมของแคลิฟอร์เนียแก่นักท่องเที่ยว
มิชชันแห่งนี้เคยมีช่วงเวลาแห่งความรุ่งเรืองที่สุดในช่วงจุดเปลี่ยนของศตวรรษ และในปี 1806 มีจำนวนประชากรทั้งสิ้นมากกว่า 1,000 คน ทุกคนล้วนแล้วแต่เป็นเจ้าของปศุสัตว์ ในอดีตรวมถึงปัจจุบัน จุดศูนย์กลางของที่นี่คือโบสถ์เกรทสโตน นับเป็นชัยชนะทางสถาปัตยกรรม
เดินชมการแสดงส่วนต่างๆ ในพิพิธภัณฑ์ที่มีพื้นที่ราว 10 เอเคอร์ ประกอบไปด้วยสวนสวย น้ำพุและส่วนที่เป็นสถาปัตยกรรมที่ได้รับการอนุรักษ์ไว้เป็นอย่างดี รวมถึงห้องสวดมนตร์โบราณด้วย เด็กๆ จะสนุกไปกับการให้อาหารปลาคาร์ฟ เดินชมความงามของสถาปัตยกรรมที่ทำจากอิฐดิบ หรือกิจกรรมที่เหมาะกับทุกเพศ ทุกวัย อย่างการลองสานตะกร้าแบบอเมริกัน ซึ่งจะจัดให้ร่วมสนุกกันสองครั้งต่อเดือน
ถ้าคุณเข้ามาในเดือนมีนาคม ต้องไม่พลาดชมปรากฏการณ์ Return of the Swallows หรือนกนางแอ่นคืนถิ่น ซึ่งจะเกิดขึ้นในวันเซนต์โยเซฟ ฝูงนกจำนวนมากจะบินกลับมาที่มิชชันเป็นประจำทุกปีเพื่อมาสร้างรังบริเวณซากปรักหักพังของโบสถ์ เพื่อเป็นการฉลองต้อนรับการบินกลับถิ่นของนกนางแอ่น จึงมีการจัดงานรื่นเริงที่มิชชัน เช่น การแสดงดนตรีมาเรียซซีซึ่งเป็นดนตรีสไตล์เม็กซิกัน รวมถึงการแสดงและการนำเสนอผลงานที่น่าสนใจอื่นๆ
มิชชัน ซาน ฮวน คาปิสทราโน เปิดให้เข้าชมทุกวัน ยกเว้นวันหยุดราชการบางวัน พยายามหาเวลามาที่นี่ให้ได้เต็มวันแล้วเดินชมให้ทั่วบริเวณและร่วมเป็นส่วนหนึ่งของกิจกรรมที่จัดขึ้นเป็นประจำทุกวันของที่นี่ ถ้าอยากยืดแข้งยืดขาสักหน่อย ต้องลองเดินไปกับทัวร์ที่โดยใช้เวลาทั้งสิ้นหนึ่งชั่วโมงและจัดเป็นประจำทุกสัปดาห์ หรือจะทัวร์ด้วยตัวเองแบบมีข้อมูลสำเร็จรูปให้ฟังก็ได้ (เข้าฟรีโดยไม่เสียค่าใช้จ่าย)
จากตัวเมืองซานตาอานาหรือห้างเซาธ์โคสต์พลาซ่า ใช้เวลาขับรถมายังมิชชัน ซาน ฮวน คาปิสทราโนประมาณ 25 นาที มีลานจอดรถสาธารณะ ไม่เสียค่าใช้จ่าย บริเวณนี้มีรถโดยสารสาธารณะวิ่งผ่านด้วย