มองดูลักษณะภายนอกคล้ายป้อมปราการเรียบๆ ของสถานที่ศักดิ์สิทธิ์อาโตโตนิลโก ก่อนที่เข้าไปดูสีสันที่สดใสเบื้องหลังกำแพงสีขาว ภายในศาสนสถานสมัยศตวรรษที่ 18 หลังนี้ มีภาพจิตรกรรมฝาผนังและภาพวาดปูนเปียกที่อลังการประดับตามฝาผนัง คูหาสวดมนต์และเพดาน สถานที่ศักดิ์สิทธิ์แห่งนี้เป็นศาสนสถานคาทอลิกที่ได้รับการนับถือมากที่สุดแห่งหนึ่งในเม็กซิโก ดึงดูดนักท่องเที่ยวหลายพันคนในแต่ละสัปดาห์
ศึกษารายละเอียดของภาพวาดปูนเปียก หลายรูปแสดงการประสูติและการสิ้นพระชนม์ของพระเยซูคริสต์และหน้าประวัติศาสตร์ในการพิชิตโลกใหม่ของสเปน บางรูปก็ดูน่าสยดสยอง รวมทั้งรูปพระเยซูที่กำลังเสียพระโลหิตอย่างหนักท่ามกลางซากศพและร่างที่กำลังเน่าเปื่อย
มองขึ้นไปที่เพดานเพื่อดูภาพจิตรกรรมสีสันสวยงามของวาระสุดท้ายในพระชนม์ชีพของพระเยซู รวมทั้งการตรึงไม้กางเขนของพระองค์ จารึกหลุมฝังศพของบาทหลวงเนรี อัลฟาโร ผู้ก่อตั้งสถานที่ศักดิ์สิทธิ์แห่งนี้ อยู่ใกล้ๆ กับแท่นบูชาหลัก โดยที่ร่างของท่านนอนอยู่ในโลงศพในผนัง ข้อปฏิบัติที่เคร่งครัดข้อหนึ่งของบาทหลวงเนรีคือการเฆี่ยนตีตัวเอง เพื่อลอกเลียนการทุกข์ทรมานของพระเยซูระหว่างทางไปยังไม้กางเขน การเฆี่ยนตีตัวเองนี้ยังคงได้รับการปฏิบัติโดยนักแสวงบุญบางคนที่มาที่นี่
ดูรูปปั้นไม้ The Lord of the Column สมัยศตวรรษที่ 19 ของพระเยซูที่พระวรกายอาบพระโลหิตจากการเฆี่ยนที่พระองค์ได้รับ ทุกๆ ปี รูปบูชาสำคัญนี้จะถูกแห่จากสถานที่ศักดิ์สิทธิ์ไปยังซานมิเกลเดอาเยนเด โดยเป็นส่วนหนึ่งของเทศกาลก่อนอีสเตอร์
เยี่ยมชมคูหาสวดมนต์ที่ประดับประดาอย่างหรูหรา รวมทั้งห้องสวดมนต์แห่งอัครสาวกหลังแท่นบูชาใหญ่ โดยมีรูปปั้นของพระแม่มารีและสาวกที่ใกล้ชิดที่สุดของพระเยซูคริสต์ ส่วนอื่นๆ ในโบสถ์หลักของสถานที่ศักดิ์สิทธิ์แห่งนี้ มีรูปภาพจำนวนมากของนักบุญ นักพรต มังกร งู มารและปีศาจ
ศูนย์กลางศาสนาแห่งนี้ยังมีความสำคัญทางประวัติศาสตร์อีกด้วย ใน ค.ศ. 1810 นักปฏิวัติชาวเม็กซิโก บาทหลวงมิเกล อิดัลโก ชูธงพระแม่แห่งกวาดาลูเปของสถานที่ศักดิ์สิทธิ์แห่งนี้ในการสู้รบ ดูธงจำลองในห้องเก็บเครื่องพิธี
สถานที่ศักดิ์สิทธิ์อาโตโตนิลโกตั้งอยู่ในเมืองอาโตโตนิลโก ราวๆ 14 กม. จากซานมิเกลเดอาเยนเด ขับรถ ขึ้นแท็กซี่หรือนั่งรถประจำทาง