ถึงแม้ว่าลักษณะภายนอกจะดูน่าประทับใจจากลักษณะสมมาตรที่สง่างามและประติมากรรมรูปนูนที่วิจิตรประณีต แต่สิ่งล้ำค่าที่แท้จริงกลับซ่อนอยู่ภายในพิพิธภัณฑ์อากีแตนแห่งนี้ พิพิธภัณฑ์ดังกล่าวจัดแสดงสิ่งของตามลำดับเวลา เพื่อบันทึกเรื่องราวในอดีตอันมีสีสันของแคว้น ซึ่งจะได้พลิกฟื้นยุคต่างๆ จากหน้าประวัติศาสตร์ของฝรั่งเศสให้กลับมามีชีวิตอีกครั้ง เดินชมการจัดแสดงของที่นี่ และเรียนรู้เกี่ยวกับอากีแตน บอร์กโดซ์ และผู้คนที่ใช้ชีวิตที่นี่ในยุคต่างๆ
ในช่วงทศวรรษ 1960 นักพิพิธภัณฑ์วิทยานามว่า ฌอร์ฌ อองรี ได้วางแผนเครือข่ายพิพิธภัณฑ์ทั่วประเทศฝรั่งเศส โดยได้วางแผนให้มีพิพิธภัณฑ์หนึ่งแห่งต่อเมืองหลวงของแคว้น ซึ่งจะได้บันทึกเรื่องราวในอดีตของพื้นที่นั้นอย่างเป็นวิทยาศาสตร์ พิพิธภัณฑ์อากีแตนเป็นส่วนหนึ่งของแผนการดังกล่าว และก่อตั้งขึ้นครั้งแรกใน ค.ศ. 1962 โดยได้ย้ายมายังสถานที่ปัจจุบัน ซึ่งเป็นอาคารมหาวิทยาลัยเก่า ใน ค.ศ. 1987
ตามรอยการพัฒนาของพื้นที่นี้จากศตวรรษหนึ่งมาสู่อีกศตวรรษหนึ่งผ่านการจัดแสดง ซึ่งเริ่มต้นในสมัยก่อนประวัติศาสตร์ และบันทึกประวัติศาสตร์ของอากีแตนมาจนถึงศตวรรษที่ 20 วัตถุที่น่าสนใจเป็นพิเศษชิ้นหนึ่งคือ รูปนูนต่ำ Laussel Venus ที่แสดงภาพสตรีมีครรภ์ ซึ่งมีอายุจากราวๆ 25,000 ปีก่อนคริสตกาล โดยจุดกำเนิดและจุดประสงค์ยังคงเป็นเรื่องลึกลับ
สำรวจศิลปวัตถุจากยุคคลาสสิก ซึ่งบันทึกอิทธิพลของโรมันที่มีต่อฝรั่งเศส เช่น แท่นบูชาผู้คุ้มครอง (Altar of Tutela) จากศตวรรษที่ 1 สังเกตความก้าวหน้าของแคว้นผ่านยุคกลางในการจัดแสดงที่อุทิศให้กับเอเลนอร์แห่งอากีแตนและประวัติศาสตร์ของนักแสวงบุญ มีการจัดแสดงที่อุทิศให้กับชีวิตและผลงานของมีเชล เดอ มงตาญ นักประพันธ์และนักปรัชญาชาวเมืองบอร์กโดซ์ มองหาอนุสาวรีย์ที่สร้างขึ้นเป็นเกียรติให้แก่ท่านได้ที่ตรงกลาง
พิพิธภัณฑ์แห่งนี้แบ่งเป็นห้องต่างๆ โดยเน้นที่การเดินทางของอากีแตนสู่โลกยุคใหม่ การสำรวจการค้าทางทะเล การปฏิวัติฝรั่งเศส และการกำเนิดการขนส่งเดินทางสมัยใหม่ ห้ามพลาดชมรูปจำลองที่ละเอียดของร้านขายของชำสมัยต้นศตวรรษที่ 20 ซึ่งมีเครื่องเรือนและเครื่องตกแต่งจากราวๆ ค.ศ. 1900
เดินทางมาที่พิพิธภัณฑ์อากีแตนได้โดยการนั่งรถรางมาลงที่ป้ายพิพิธภัณฑ์อากีแตน (Musée d'Aquitaine) หรือไม่ก็เดิน 30 นาทีจากสถานีการ์เดอแซงต์ฌอง (Gare de St. Jean) อากีแตนพิพิธภัณฑ์เปิดทุกวัน ยกเว้นวันจันทร์และวันหยุดราชการ ปกติต้องเสียค่าเข้าชม แต่วันอาทิตย์แรกของเดือนเข้าชมได้ฟรี